Die Biotechnologieindustrie beruht auf Cleanrooms, um biologische Produkte, wie Impfstoffe und Biologics, mit einer hohen Stufe der Reinheit und der Übereinstimmung herzustellen. Cleanrooms in der Biotechnologie sind entworfen, um Umweltfaktoren wie Temperatur, Feuchtigkeit und Luftstrom sowie das Niveau von zerstreuten Partikeln, von Bakterien und von anderen Schadstoffen zu steuern.

Cleanrooms in der Biotechnologie werden gewöhnlich entsprechend ihrem Niveau von Sauberkeit klassifiziert, wenn Klasse A Cleanrooms das zwingendste sind. Der Gebrauch des Spezialgeräts und der Werkzeuge, wie Hauben der laminaren Strömung und Biohazardkabinette, ist auch in den Cleanrooms in der Biotechnologie allgemein.

Um Cleanrooms in der Biotechnologie effektiv zu benutzen, ist es wichtig strengen Protokollen für das Arbeiten in der Umwelt zu folgen. Angestellte müssen fachkundige Kleidung tragen und befolgen strenge Verfahren, um die, Cleanroomumwelt zu verseuchen zu vermeiden. Darüber hinaus ist regelmäßige Wartung der Cleanroomumwelt entscheidend, die Anhäufung von Partikeln und von Schadstoffen im Laufe der Zeit zu verhindern.